鬥魚體部的皮層，有四個色層，各自分布著不同的色素細胞，而鰭部的色素極薄，或許是另一形式，還有待研究，在此暫不討論。
野生鬥魚的色層，由底層到外層、由內至外，依序排列：
1.黃色層 2.紅色層 3.黑色層 4.虹層
展鬥略有不同，色層由內至外，依序排列：
1.黃色層 2.紅色層 3.黑色層 4.虹層
黃色層 / 在黃色層仍無發現有控制色素沉積的基因，推斷可能含有胡蘿蔔色素(Xanthophores)細胞，或黃色細胞(Yellow cells)，所以目前視為肉色或許比較恰當。
黑色層 / 在這色層有三個基因，分別是柬埔寨(Cambodian)、明亮(Blond/Bright)、米拉諾(Melano)。
1) 柬埔寨：為雙份隱性，所以當無黑色素沉積時，會顯現出肉色。
2) 明亮：也為雙份隱性，為體色提供更好的反射效果。
3) 米拉諾：與柬埔寨相反，增加黑色素沉積。
紅色層 / 在這色層有四個基因，分別是擴散紅(Extended red)、減紅(Reduced red)、無紅(Non-red)、雜色鰭(Variegated fins)。
1) 擴散紅：使體部與鰭部皆有很濃郁的紅色。
2) 減紅： 色度較為明亮，較淡較淺。
3) 無紅： 在這色層無紅色色素沉積。
4) 雜色鰭： 也就是一般所謂蝶翼效應。
虹層 / 因控制了藍色色素，所以也可稱為藍色層，在這層的色素細胞特性包括虹彩色(Iridescent colors)、擴張虹彩(Spread iridocytes)、無藍(Non-blue)。
1)虹彩色： 表面結構會造成繞射現象。
2)擴張虹彩： 最好的例子就是由傳統黑頭發展到甲面。
3)無藍： 若能完全消除藍色，那證明無藍基因存在。
